MKVtools foi projetado principalmente para processamento de arquivos mkv para uso em leitores de DVD habilitados DivX, it's capabilites foram expandidos para permitir a entrada da maioria dos formatos de arquivos de vídeo padrão. Como o tipo de nome implica, MKVtools é uma interface gráfica para uma variedade de ferramentas úteis para o processamento de arquivos de vídeo.